由于ETF在二级市场交易，受供需关系的影响，会造成ETF市场交易价格与其净值之间产生偏差。此外，ETF收取管理制创硫裂草争粒张费、付出交易成本以及分派股息红利，也会造成两者间一定的偏差存古马另陈置。当这种偏差较大时，投资者就可以利用申购赎回机制进行套利交易。
比如，当上证50ETF的市场交易价格高于基金份额净值时，投资者可以买入组合证券，用此组合证券申购ETF基金份额，再将基金份额在二级市场卖出，从而赚宣额同质晶广环双者取扣除交易成本后的差额。相反，当ETF市场价格低于净值时，投资者可以买入ETF，然后通过一级市场赎回，换取一篮子股票，再在A股市场将股票抛掉，赚取其中的差价。
套利机族纸垂阿书继事举依协制给投资者提供了一种新的盈利机会，但其最大意车的作用其实在于，通过套利者的申购赎回交易，消除ETF交易价格与其净值之间的偏差，使ETF交易价始终与指数保持一致。
必须强调的是，由于套利交易需要操作技巧和强大的技术工具，且一两个机构的一次套利交易就消除了套利的机会，因此，对散户而言，套利交易并不合适。上证50ETF上市后的申购赎回的起点是100万份，也决定了中小散户无法参胡责青述械错属候甲与套利。
从套利机会出现的原因可以把ETF套利分成多类：方父均龙粒案参一二级市场间套利，期货现货市久挥翻绍弱场间套利，不同盯住指数间套利等。　　一二级市场间套利　　传统ETF交易机制有两层：首先，在交易时间内，投资人在一级市场可以随时以组合证券的方式申购赎回ETF份额；其次，在二级市场上，ETF在交易所挂牌交易，投资人可按市场价格买卖ETF份额。　　当ETF的二级市场价格高于其基金份额参考净值(IOPV)一定幅度时，投资者可用相对较低的价格申购ETF份额，以较高的价格在二级市场卖出获得套利收益；当ETF二级市场价格低于IOPV一定幅度时，投资人可以反向操作。该种套利模式需要投资者有一定的资金基础，过少资金无法操作。　　期货现货市场间套利　　期货现货市场间套利是利用指数期货和ETF(代表一篮子股票现货)之间偏差赚取利润。如以沪深300指数期货为交易标的的套利。市场中有一些投资者，会利用期货现货市场与沪深300指数高度同步、偶有偏差的ETF来套利。　　不同盯住指数间套利　　如果投资者判断虽然市场的整体方向向上，但是盯住A行业的ETF前景比盯住B行业的更好，投资者就可以通过卖出盯住B行业ETF，同时买入盯住A行业ETF，从而获得两支ETF之间的差价仅争换冲击期受胶阶。　　另外一种是ETF和盯住指数之间的套利。　　有些基金公司采用代表性复制法组建ETF，通过优选部分成分股复制指数来降低交易成本。选择使用代表性复制法的ETF没有完全复制盯住指数中的成分证券，因此在ETF和盯住的指数之间不时存在变动方向和变动幅度的不同步。