它们最大的区别就是画笔的硬度可以调整。边缘柔化程度随硬度的大小设置而改变，铅笔虽然也可以调整，但是无论调大调小效果都是一样的边缘锐利。
颜 {MOD}替换工具，顾名思义就是用来替换掉颜 {MOD}的，就是用自定义的颜 {MOD}以选定的限制方式替换掉取样颜 {MOD}。比如，图像上有朵红花，想把它换成蓝 {MOD}，那用这个工具就行，在拾 {MOD}器把前景定为蓝 {MOD}，然后选择此工具，在属性里设置好，然后涂沫红花就变蓝了。

画笔工具可以通过不同大小的像素和虚实效果调整出不同粗细、不同软硬程度、不同形状的线条，一般都有预置的笔刷素材，有软边及硬边的区别和各种形样式。而对于铅笔而言，就显得单调许多，只能通过像素大小的设置绘制出不同组细的“硬边”线条。使用画笔工具画出的线条边缘很柔和，哪怕是用硬边画笔，边缘也不会有锯齿，而用铅笔工具画出的线条会显得生硬，一般线条的边缘会有锯齿出现。
颜 {MOD}替换工具 ：
在选项栏中选取画笔笔尖。通常，您希望使混合模式仍然设置为“颜 {MOD}”（请参阅设置绘画和编辑工具的选项）。
对于“取样”选项，选取下列选项之一：
“连续”：在拖移时对颜 {MOD}连续取样
“一次”：只替换第一次点按的颜 {MOD}所在区域中的目标颜 {MOD}
“背景 {MOD}板”：只抹除包含当前背景 {MOD}的区域
对于“限制”选项，请选择下列选项之一：
“不连续”：替换出现在指针下任何位置的样本颜 {MOD}
“邻近”：替换与紧挨在指针下的颜 {MOD}邻近的颜 {MOD}
“查找边缘”：替换包含样本颜 {MOD}的相连区域，同时更好地保留形状边缘的锐化程度
对于“容差”，输入一个百分比值（范围为 1 到 100）或者拖移滑块。选取较低的百分比可以替换与所点按像素非常相似的颜 {MOD}，而增加该百分比可替换范围更广的颜 {MOD}。
要为所校正的区域定义平滑的边缘，请选择“消除锯齿”。
要替换不需要的颜 {MOD}，请选择要使用的前景 {MOD}。
在图像中点按要替换的颜 {MOD}。
在图像中拖移可替换目标颜 {MOD}。