1、群体混选：必须严格选择具有本品种典型性状的丰产性能好的雌、雄株。
选择可分三次进行：第一次营养生长盛期，把不符合标准的植株全部拔除，第2次在绝对雄蕊抽苔而未散粉的时期，根据植株高矮，开展度大小和叶片形状、选择生长旺盛、叶片大、营养生长期长的植株，把其余的（包括绝对雄株）植株全部拔除。第三次在雌蕊开花前，除保持一部分雌雄株或两性花植株外，把其余的雄株，劣株全部拔除。
在选苗的雌株的种子变 {MOD}，茎叶变黄时，即可收割混合采种。
2、原种繁育圃：鉴定比较原种后代特性，并通过再一次群体混合选择，以提高种性。
3、原种圃：进一步鉴定其种子的典型性，丰产性和一致性，并繁殖大量的原种供下年原种生产田和生产用种。
采种方式
1、秋播越冬采种：长江流域一般11月上中旬播种
菠菜
菠菜(4张)
种株在5～7片真叶时越冬，翌年春季抽苔开花结实，采用此法采种的籽粒大产量高，主要用来繁殖原种。
2、冬播采种法：（北方采用）
种子在土壤中越冬，当年不发芽（播前不可催芽）次年3月初即可陆续出苗，采用此法，种子产量较低，但占地时间短。
3、春播采种法：3月份播种，当年收种子，此法采种的籽粒小，产量低，（抗寒性较弱、不越冬的菠菜品种可用此法采种）
种株的管理的采收
菠菜种子充分成熟后容易脱粒，又由于菠菜种株各部位开花的先后不同，导致种子成熟期不一致。因此，当种株有1/3～1/2变黄时，就应全部收获，收获应在早晨露水未干时进行为宜，收获后的种株，在干燥的地方堆置几天时间，以待种子后熟，然后抢晴天让其充分干燥脱粒。
杂交
菠菜
菠菜
菠菜在有刺种与无刺种间的一代杂种优势明显，且采种量也多，因此，国内外生产中正在大量使用一代杂种。生产杂种的方法有以下二种。
品种（自交系）间杂交
将两个配合力高的品种（或自交系）隔行种植，在抽苔时，将母本行中的雄株、雌雄同株的植株拔除，在隔离区中让其自由授粉，然后从母本株上采收的种子为一代杂种，这种方法亲本保存繁殖容易，种子产量较高，但是拔雄工作费时，拔雄工作不彻底时，易出现假杂种。
利用雌株系制种
经过选育获得了优良的雌株系后，就可利用雌株系作母本，优良自交系作父本，在隔离区中隔行种植，一般雌株系4行，父本1行，任期自由授粉，从雌株系上收的种子为一代杂种。
注意事项
1、应选用尖叶类型作母本、圆叶类型作父本，这种配组生产的杂种优势强反之优势较弱，而同类型品种之间杂交配制一代杂种，其优势更弱。
2、注意调整花期：圆叶菠菜抽苔开花期比尖叶品种要晚，为了使花期相遇，应提前播种父体，或对父本进行药剂处理，一般母本在11月上旬播种，父本可在10月下旬播种。
3、父母本栽植方式和比例：为了有利于传粉，父母本行向应为东西向，父母本之比为1：4或2：8。
4、及时拔除母本中的雄株，以免产生假杂种。拔除方法同上，同时也在拔除父本行中的雌株，以保证母本株上有充分的花粉。
5、授粉完毕后，要及时把父本植株全部拔除，以防收获种株时产生机械混杂。